Przełęcz znajduje się w środku odległości 54 kilometrów (34 mil) na brzask od chwili stolicy stanu Sikkim, Gangtok również w środku odległości 430 kilometrów (270 mil) odkąd stolicy Tybetu, Lhasy[16][17]. Nathu La znajduje się na terenie jednej z największych dróg handlowych na świecie[18], zwanej jedwabnym szlakiem. Zimą na terenie przełęczy występują duże opady śniegu, co utrudnia komunikację z innymi regionami. Ponieważ wewnątrz Nathu La nie ma stacji meteorologicznej, systematyczne pomiary opadów atmosferycznych także temperatury nie są prowadzone[19]. Mimo to wiadomo, że na pobliskich, wyższych szczytach Himalajów wysoka temperatura w środku lecie wynosi dookoła 15°C[20].
Nathu La posiada nieco płytką, zbyt odwadnianą, gruboziarnistą oraz ilastą glebę na stromych stokach (30-50%) ze żwirowo iłową powierzchnią ze średnią ilością skał. Występuje umiarkowana erozja[16]. W kilku miejscach istnieją osuwiska podatne na zsuwanie się ziemi[21]. W celu ochrony delikatnego otoczenia Nathu La po indyjskiej stronie, władza Indii reguluje liczba odwiedzających to obszar turystów. Utrzymanie umiłowany jest powierzone Border Roads Organisation – części indyjskiej armii[22]. Po chińskiej stronie przełęcz prowadzi do Doliny Chumbi na Wyżynie Tybetańskiej[23].